Kendala intern dalam pengembangan industri kecil adalah kualitas SDM yang masih rendah, lemahnya permodalan, jaringan usaha dengan pelaku-pelaku ekonomi lainnya dan pangsa pasar serta manajemen, sedangkan yang dimaksud dengan kendala ekstern adalah akses sarana dan prasarana, ekonomi yang belum memadai dan masih terpusat di Jawa. Iklim usaha yang kurang kondusif karena adanya persaingan yang belum sehat serta pembinaan yang belum terpadu dari Departemen terkait.